Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm8869-201ENSMUST00000195222 947 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm19174-201ENSMUST00000216944 956 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 3830406C13Rik-205ENSMUST00000223702 900 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Zfp626-201ENSMUST00000080175 816 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm3238W4VSP7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Olfr1003-ps1-201ENSMUST00000122238 717 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Asb11-202ENSMUST00000036858 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm3238W4VSP7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms