Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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