Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms