Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn6Q9Z262 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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