Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ap3b1Q9Z1T1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ap3b1Q9Z1T1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms