Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Nme3Q9WV85 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms