Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp1a4Q9WV27 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atp1a4Q9WV27 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms