Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trpc2Q9R244 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpc2Q9R244 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Trpc2Q9R244 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Trpc2Q9R244 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trpc2Q9R244 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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