Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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BcamQ9R069 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BcamQ9R069 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms