Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AmfrQ9R049 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AmfrQ9R049 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms