Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col4a3Q9QZS0 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms