Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gpc1Q9QZF2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gpc1Q9QZF2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gpc1Q9QZF2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gpc1Q9QZF2 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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