Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChmQ9QXG2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms