Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Rabgef1Q9JM13 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rabgef1Q9JM13 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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