Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Col5a3Q9JLI2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Col5a3Q9JLI2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Col5a3Q9JLI2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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