Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Usp29Q9ES63 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Usp29Q9ES63 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms