Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trmt112Q9DCG9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms