Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ftsj3Q9DBE9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ftsj3Q9DBE9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms