Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Q9D8N1 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Q9D8N1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Q9D8N1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms