Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc91Q9D8L5 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms