Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp4bQ9D8B3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp4bQ9D8B3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms