Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc81Q9D5W4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc81Q9D5W4 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms