Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Zcchc13Q9D548 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms