Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhox2aQ9D4Y3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms