Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc83Q9D4V3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms