Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lonrf3Q9D4H7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms