Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubgcp4Q9D4F8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms