Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Syce1Q9D495 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms