Protein–RNA interactions for Protein: Q9D328

Tmem35a, Transmembrane protein 35A, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35aQ9D328 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tmem35aQ9D328 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms