Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lmbr1lQ9D1E5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms