Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ndc80Q9D0F1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ndc80Q9D0F1 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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