Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CYI0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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