Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
ChtopQ9CY57 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
ChtopQ9CY57 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms