Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Tmed5Q9CXE7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Tmed5Q9CXE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms