Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RpainQ9CWY9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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RpainQ9CWY9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RpainQ9CWY9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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