Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pin4Q9CWW6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pin4Q9CWW6 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms