Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prkrip1Q9CWV6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prkrip1Q9CWV6 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms