Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lhfpl3Q9CTN8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms