Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snw1Q9CSN1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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