Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gtf2a1Q99PM3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms