Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
GpnmbQ99P91 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms