Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brms1Q99N20 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms