Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tdrd1Q99MV1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms