Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms