Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp11Q99K46 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp11Q99K46 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms