Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Bbox1Q924Y0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms