Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx9Q91VH2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms