Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rprd1aQ8VDS4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Rprd1aQ8VDS4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rprd1aQ8VDS4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rprd1aQ8VDS4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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