Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam20bQ8VCS3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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