Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BbxQ8VBW5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms